El Instituto de Idiomas de Ceuta cuenta con una Dirección, que desarrolla sus funciones conforme a lo previsto en los Estatutos del organismo y en la normativa aplicable. 

Para el desarrollo de su actividad, el Instituto dispone de  personal docente encargado de la impartición de los cursos de idiomas, así como de personal administrativo y de apoyo  que gestiona las tareas de administración, atención al alumnado y funcionamiento general del centro. 

La estructura organizativa del Instituto permite el desarrollo de la actividad docente y la adecuada prestación del servicio público de enseñanza de idiomas.